Category: General biology

(Icelandic) Getur kórónuveiran sem veldur COVID-19 stökkbreyst og orðið hættulegri?

Arnar Pálsson, 15/04/2020

Sorry, this entry is only available in Icelandic.

Videos from conference of Bioethics of clinical innovation and unproven methods, Copenhagen, 9 April 2019

Arnar Pálsson, 13/11/2019

Bioethics of clinical innovation and unproven methods, Copenhagen, 9 April 2019

Conference organized by the Nordic Committee on Bioethics in collaboration with Centre for Legal Studies in Welfare and Market at the University of Copenhagen. The central questions were:

How are clinical innovations and unproven methods developed and introduced in western Nordic health-care systems?

What is the legal and regulatory environment concerning unproven methods in medicine?

What ethical principles should guide work on emerging treatments and experimentation in hospitals?

These are questions that were addressed in the NCBio-conference in Copenhagen.

You can read more about the conference here.

I had the great privilege of organizing this event with my colleagues in the Nordic Committee on Bioethics, in collaboration with the Centre for Legal Studies in Welfare and Market at the University of Copenhagen.
Venue: Alf Ross auditorium (room 9A-3-01), Faculty of Law, University of Copenhagen, Karen Blixens Plads 16, 2300 Copenhagen S.
Background: Clinical innovation involves development of new techinques, methods, treatments and diagnostics for detecting, alleviating and curing diseases. By nature novel clinical methods and treatments are unproven when first developed. Through the centuries, medicine has advanced by trials and errors of physicians and researchers experimenting with treatments and methods. The failure of certain methods are inseparable from success of others, because a priori it is hard to know what works and what not. The scientific method is the preferred approach to develop cures and treatments, but many current medical practices were not developed by strict scientific testing or trials. Healthcare professionals may try unproven methods, for instance as a last resort in attempt to safe a life. Such unproven methods for clinics and health care, occur at the intersect of basic research and standard health-care and raise number of bioethical issues. Those include the following issues. Do patients have sufficient and equal access to the experimental methods? Are patients protected from harm when unproven methods are tested? Who should make decisions about when to experiment with a treatment? How can society and the health care system best simultaneously promote clinical innovation and protect patients?

The conference is open to all interested, including medical doctors, clinical researchers, health committees in parliments, civil servants and hospital administrators.

(Icelandic) Ný grein um bleikjuafbrigðin í Þingvallavatni

Arnar Pálsson, 24/09/2019

Icelandic press about the paper on differentiation between the sympatric morphs in Lake Thingvallavatn.

Útdauði tegunda og blinda okkar á hægar breytingar

Arnar Pálsson, 11/03/2019

Útdauði dýra er raunverulegt vandamál og hann getur haft alvarlegar afleiðingar.

Ástæður útdauða eru margvíslegar, ofveiðar, eyðing búsvæða, landnýting, mengun frá t.d. landbúnaði og iðnaði, og vitanlega loftslagsbreytingar.

Í fyrri viku bárust tíðindi af því að fyrsta spendýrið hafi dáið út augljóslega af völdum loftslagsbreytinga.

Tegund sem kallaðist Bramble Cay melomys, var mús sem bjó á lítilli Ástralskri eyju. Hún lifði á litlu rifi milli Ástralíu og Papúa nýju gíneu.

Hækkandi sjávarstaða vegna loftslagbreytinga eyddi búsvæðum á eyjunni. Vitað var um afdrif hennar, vegna þess að hún hafði verið rannsökuð og bjó á lítilli eyju (og vegna þess að hún var sæt mús). Fyrir hverja eina slíka tegund sem við missum, er hætt við að við missum tugi, hundruði, þúsundir annara, ekki jafn vel þekktra eða minna heillandi, vegna loftslagsbreytinga.

Endurfundur skjaldbökunnar

Á svipuðum tíma bárust fréttir af því að skjaldbaka sem talin var útdauð fannst aftur. Skjaldbakan Chelonoidis phantasticus (Kelenædis fantastíkus með íslenskri latínu), býr á Fernandina eyjunni í Galápagoseyjaklasanum. Síðast sást til tegundarinnar fyrir 110 árum, og talið var að hún væri útdauð í kjölfar eldgos. En náttúrufræðingar höfðu fundið margvíslegar vísbendingar um tilvist skjaldböku á eyjunni, m.a. grunsamlegan saur. Með samstilltu stórátaki fannst ein skjaldbaka tegundarinnar. Ljóst er að þó eitt eintak hafi fundist og tegundin ekki formlega útdauð, eru ekki margir einstaklingar eftir.

Blessunarlega eru ennþá óspillt svæði á jörðinni, m.a. á Galapagos eyjum, með stóra þjóðgarða þar sem dýr og aðrar lífverur hafa athvarf. Þau athvörf eru samt of fá, lítil og fer fækkandi.

Hrun skordýra

Nokkrar nýlegar rannsóknir hafa afhjúpað hnignun stofna skordýra. Rannsóknir á skordýrum eru mun erfiðari en á stærri dýrum og gögnin sem fyrir liggja gloppóttari. Samt er augljóst að stofnar skordýra hafa látið á sjá, eins og þekkist e.t.v. best á ástandi býflugnastofna í Evrópu og norður Ameríku. Fréttir um skordýrahrunið voru kannski aðeins of dramatískar, en þær vörpuðu a.m.k. ljósi á vanræktan risa. Skordýr eru ákaflega mikilvæg, í vistkerfum og fyrir landbúnað, en veruleikinn er sá að við þekkjum þau fáranlega illa. Skordýr tilheyra liðdýrum, sem eru 80% af öllum þekktum tegundum dýra. Til að mynda hefur um 900.000 skordýrategundum verið lýst. Talið er að heildarfjöldi tegunda skordýra sé eitthvað í kringum 30 milljónir. Til samanburðar eru bara þekktar um 6500 spendyrategundir. Ólíklegt er að margar tegundir spendýra séu ófundnar.

Spurt var, getur erfðafræðin hjálpað okkur við að bjarga tegundum frá útdauða?

Þrennt hefur verið nefnt. Notkun erfðagreiningar til að skilja fjölbreytileika tegunda og stofna, notun erfðaupplýsinga til að stýra æxlunum tegunda í útrýmingarhættu (til að forðast innæxlun eins og í dýragörðum), eða nota sameindaerfðafræði og frumulíffræði til að klóna tegundir eða erfðabreyta núlifandi tegundum þannig að þær líkist útdauðum (t.d. fíl í loðfíl).

Fyrri nálganirnar tvær er auðveldar í framkvæmd og mikið notaðar, hin síðastnefnda er nær því að vera vísindaskáldskapur en veruleiki. Erfðatæknin mun ekki gagnast, þrátt fyrir yfirlýsingar sumra vísindamanna, til að bjarga tegundum frá í útrýmingarhættu. Sannarlega hafa nokkrar tegundir verið klónaðar, svo sem kindur, kýr og skyldar tegundir, en einnig nokkrar aðrar. Heilmikið og kostnaðarsamt þróunarstarf er nauðsynlegt til að geta klónað einstaklinga ákveðinnar tegundar. Þannig að fyrir hverja eina tegund sem við myndum vilja klóna og bjarga á þann hátt yrðum við að leggja í mikinn startkostnað. Og alls er óvíst að klónunin heppnis. Ekki hefur tekist að klóna öll dýr sem reynt hefur verið. Dollý var t.d. afurð tilraunar 277, með klónun á kindum.

Ekki er verjandi að eyða meiri fjármunum í að búa til einn klónaðan nashyrning - en þyrfti til að halda uppi og vernda mörgþúsund ferkílómetra þjóðgarði í langan tíma.

Mikilvægust eru orsakir þess að dýr og aðrar lífverur eru í útrýmingarhættu, þ.e. gjörðir mannana. Eyðing búsvæða vegur þar mest. Ef við klónum fullt af dýrum, en setjum þau síðan í agnarsmáa þjóðgarða eða læsum inni í dýragarði, þá höfum við ekki bjargað málunum. Við höfum í besta falli afvegaleitt sjálf okkur, og frestað því að takast á við rót vandans.

Okkar mesti galli - blinda á hægar breytingar

Við manneskjurnar erum léleg í því að mæla hægfara breytingar, á náttúrunni og öðrum hlutum. Enska hugtakið sem lýsir þessum galla okkar er Shifting baseline syndrome, sem þýða mætti sem viðmiðið hreyfist heilkennið.

Frægt dæmi er af sportveiðum. Hvert einasta ár er haldin sportveiði, og einhver fiskur er stærstur og fólki finnst hann risatór. En ef bornir eru saman stærstu fiskana yfir langt tímabil, t.d. frá 1910 til 2010, sést að þeir fara sífellt minnkandi. Fólk skynjar þetta ekki, því viðmiðið færist á hverju ári.

Það sama á við um allt mat okkar á ástandi náttúrunnar (og mögulega þáttum í samfélaginu). Í Evrópu og Ameríku hefur skordýrum fækkað vegna eyðingu búsvæða, ræktarland kemur í stað villtrar náttúru, og húsahverfi í stað akra, með þeim afleiðingum að yfir ár og áratugi fækkar skordýrunum.

Þetta birtist um alla jörð, í mörgum þáttum umhverfis, og orsakirnar eru yfirleitt mennskar. Breytingar eru á loftslagi, vegna þess að við keyrum bíla, kaupum drasl og fljúgum til útlanda oft á ári! Ef við viljum bjarga sjálfum okkur, börnum okkar og lífinu á jörðinni í leiðinni, þá þurfum við að breyta hegðan okkar. Og þrýsta á stjórnvöld að taka til aðgerða. Við eigum ekki að mótmæla þegar grænir skattar eru settir á eldsneyti til að auðveld orkuskipt, eða flugfargjöld hækka til að draga úr loftslagsbreytingum! Hugsa um langtímahag ekki skammtímavellíðan.

Pistillinn var ritaður eftir samræður við Morgunútvarpsfólk á Rás 2 þann 22. febrúar 2019 (Útrýmingarhætta) og birtist fyrst á apalsson.blog.is (Útdauði tegunda og blinda okkar á hægar breytingar)

Ítarefni:

. CNN 21. febrúar 2019. Australian mammal becomes first to go extinct due to climate change. https://edition.cnn.com/2019/02/20/australia/mammal-climate-change-extinction-intl-trnd/index.html

Giant tortoise believed extinct for 100 years found in Galápagos – The guardian 21. feb 2019.

Smithsonian, fjöldi skordýra.

Ed Young 19. feb. 2019. The atlantic Is the Insect Apocalypse Really Upon Us?

By Brooke Jarvis, 27. nóv. 2018 The Insect Apocalypse Is Here.

Bioethics of clinical innovation and unproven methods Copenhagen, 9 April 2019

Arnar Pálsson, 07/02/2019
Conference organized by the Nordic Committee on Bioethics in collaboration with Centre for Legal Studies in Welfare and Market at the University of Copenhagen , in Copenhagen, 9 April 2019, 09:00 - 17:00.

How are clinical innovations and unproven methods developed and introduced in western Nordic health-care systems?

What is the legal and regulatory environment concerning unproven methods in medicine?

What ethical principles should guide work on emerging treatments and experimentation in hospitals?

These are questions that will be adressed in the upcoming NCBio-conference in Copenhagen.

You can read more about the upcoming conference here.

Sign up here

I had the great privilege of organizing this event with my colleagues in the Nordic Committee on Bioethics, in collaboration with the Centre for Legal Studies in Welfare and Market at the University of Copenhagen.
Venue: Alf Ross auditorium (room 9A-3-01), Faculty of Law, University of Copenhagen, Karen Blixens Plads 16, 2300 Copenhagen S.Register here

Background: Clinical innovation involves development of new techinques, methods, treatments and diagnostics for detecting, alleviating and curing diseases. By nature novel clinical methods and treatments are unproven when first developed. Through the centuries, medicine has advanced by trials and errors of physicians and researchers experimenting with treatments and methods. The failure of certain methods are inseparable from success of others, because a priori it is hard to know what works and what not. The scientific method is the preferred approach to develop cures and treatments, but many current medical practices were not developed by strict scientific testing or trials. Healthcare professionals may try unproven methods, for instance as a last resort in attempt to safe a life. Such unproven methods for clinics and health care, occur at the intersect of basic research and standard health-care and raise number of bioethical issues. Those include the following issues. Do patients have sufficient and equal access to the experimental methods? Are patients protected from harm when unproven methods are tested? Who should make decisions about when to experiment with a treatment? How can society and the health care system best simultaneously promote clinical innovation and protect patients?

The conference is open to all interested, including medical doctors, clinical researchers, health committees in parliments, civil servants and hospital administrators.

Talk in Holar. Evolution of developmental variation, rapid divergence, plasticity and cryptic genetic variation

Arnar Pálsson, 29/11/2018

Couple of weeks back I was lucky enough to visit Holar University College, in the north of Iceland.

There we talked about ongoing work on the Arctic charr system, including genetic variation between sympatric morphs in Lake Þingvallavatn. And some new results on compensatory evolution of gene expression in Drosophila. The discussion was awesome, we got lots of great points and discussed potential new projects.

Then we spent the day processing fishes, phenotyping and taking clippings for DNA extraction. The photo is of charr embryo just past the eying stage.

(Icelandic) Hversu mörg gen fáum við frá hverjum forföður?

Arnar Pálsson, 03/04/2018

Sorry, this entry is only available in Icelandic.

(Icelandic) Geta tveir einstaklingar farið í erfðapróf og fengið að vita hvort þeir séu samfeðra?

Arnar Pálsson, 19/09/2017

Sorry, this entry is only available in Icelandic.

(Icelandic) Tilnefningar óskast, fyrir heiðursverðlaun líffræðifélagsins

Arnar Pálsson, 22/08/2017

Sorry, this entry is only available in Icelandic.

(Icelandic) Mun norskt genaregn eyðileggja íslenska laxinn?

Arnar Pálsson, 16/01/2017

Sorry, this entry is only available in Icelandic.