Bones in motion: Ontogeny of craniofacial development in sympatric Arctic charr morphs - accepted in Developmental dynamics

Posted on: 08/06/2015 by Arnar Pálsson

Bones in motion: Ontogeny of craniofacial development in sympatric Arctic charr morphs

Kalina H. Kapralova, Zophonías O. Jónsson, Arnar Palsson, Sigrídur Rut Franzdóttir, Soizic Le Deuff, Bjarni K. Kristjanson, Sigurður S. Snorrason.

Background: The impressive diversity in the feeding apparatus often seen among related fish species clearly reflects differences in feeding modes and habitat utilization. Such variation can also be found within species. One example of such intraspecific diversity is the Arctic charr in Lake Thingvallavatn, where four distinct morphs coexist: two limnetic with evenly protruding jaws and two benthic with subterminal lower jaws. We used these recently evolved morphs to study the role of ontogenetic variation for craniofacial diversity. Continue reading →

Posted in Publications

Hvað þýðir það að erfðavísar séu ónýtir og hafa þeir áhrif á svipfar?

Posted on: 13/05/2015 by Arnar Pálsson

Hvað þýðir það að erfðavísar séu ónýtir og hafa þeir áhrif á svipfar? Gen (erfðavísar) eru mikilvægasti hluti erfðaefnisins. Erfðaefnið DNA eru tvíþátta þræðir sem mynda litningana. Við manneskjurnar fáum eitt sett af litningum frá móður og eitt sett frá föður. Því höfum við tvö heil eintök af flestum okkar genum - eitt frá hvoru foreldri. Það er kallað að vera tvílitna. Algengast er að dýr séu tvílitna en bakteríur eru flestar einlitna. Continue reading →

Posted in Vísindavefur - svör

The developmental transcriptome of contrasting Arctic charr (Salvelinus alpinus) morphs - sent to F1000research

Posted on: 17/04/2015 by Arnar Pálsson

Lets hope we are lucky third time around. Now we send this little baby to F1000research. The developmental transcriptome of contrasting Arctic charr (Salvelinus alpinus) morphs Johannes Gudbrandsson*, Ehsan P. Ahi, Sigridur R. Franzdottir, Kalina. H. Kapralova, Bjarni K. Kristjansson#, S. Sophie Steinhaeuser, Isak M. Johannesson, Valerie H. Maier, Sigurdur S. Snorrason, Zophonias O. Jonsson, and Arnar Palsson* Institute of Life and Environmental Sciences, University of Iceland, 101 Reykjavik, Iceland #Holar University College, 551 Saudarkrokur, Iceland *Corresponding authors.

Continue reading →

Posted in Publications

Vísindavefur: Hvað eru HeLa-frumur?

Posted on: 26/03/2015 by Arnar Pálsson

Hvað eru HeLa-frumur? Arnar Pálsson. „Hvað eru HeLa-frumur?“. Vísindavefurinn 9.3.2015. http://visindavefur.is/?id=69338. Árið 1951 innritaðist rúmlega þrítug kona, Henrietta Lacks (1920–1951), á John Hopkins-spítalann í Baltimore sem á þessum tíma var einn fárra spítala sem meðhöndluðu blökkufólk. Ástæða spítalavistarinnar var hnútur í kviðarholi sem læknar greindu síðan sem krabbamein á leginu. Því miður dugði meðferð ekki til að bjarga lífi hennar en hún lést október þetta sama ár. Seinna kom í ljós að orsökin var HPV-sýking sem er ein algengasta orsök leghálskrabbameins. Á meðan á meðferð Henríettu stóð voru frumur fjarlægðar úr æxlinu og setti vísindamaðurinn George Gey (1899-1970) þær í rækt, að Henríettu forspurðri.

Continue reading →

Posted in Vísindavefur - svör

Submitted to Plos One: The developmental transcriptome of contrasting Arctic charr (Salvelinus alpinus) morphs

Posted on: 24/02/2015 by Arnar Pálsson

We just sent this manuscript to PLoS One, after G3 decided they did not like it. (Main sticking point is that they wanted de novo assembly - but we argued it was not a good idea with the 36bp non paired end reads) At any rate, I like PLoS One, and would like to publish one paper there a year...

Continue reading →

Posted in Publications

Ég heiti Hekla, ef ég set DNA úr mér í plöntu verður þá plantan Hekluplanta?

Posted on: 24/02/2015 by Arnar Pálsson

Ég heiti Hekla, ef ég set DNA úr mér í plöntu verður þá plantan Hekluplanta? Afkvæmi líkjast foreldrum sínum því þau fá erfðaefni (DNA) frá þeim. Þetta á við um öll afkvæmi, hvort sem þau eru börn, dýr, plöntur eða aðrar lífverur enda er DNA erfðaefni allra lífvera á jörðinni. Í náttúrunni getur DNA flust á milli einstaklinga, en það er frekar sjaldgæft. Dæmi eru um að DNA og gen flytjist á milli ólíkra tegunda baktería, og nokkur dæmi eru um flutning inn í dýr eða plöntur.

Continue reading →

Posted in Vísindavefur - svör

Í hvaða landi eða landsvæði eru rauðhærðir algengastir?

Posted on: 24/02/2015 by Arnar Pálsson

Í hvaða landi eða landsvæði eru rauðhærðir algengastir? Hvar er Ísland í röðinni hvað varðar hlutfall rauðhærðra? Er hægt að sjá með DNA-rannsókn hvaðan rauðhærðir Íslendingar koma? Rautt hár er algengast meðal Vesturlandabúa, en nær óþekkt hjá upprunalegum ættbálkum Afríku, Ameríku og Ástralíu. Rautt hár finnst að auki í nokkrum asískum ættbálkum. Í Vestur-Evrópu er það algengast á Bretlandseyjum.

Continue reading →

Posted in Vísindavefur - svör

(Icelandic) Tilviljun og tilgangur í lífi og eilífð: Um Tilviljun og nauðsyn eftir Jacques Monod

Posted on: 29/01/2015 by Arnar Pálsson

Sorry, this entry is only available in Icelandic.

Posted in Publications

Grein um Agnar Ingólfsson, fyrsta formann Líffræðifélagsins

Posted on: 26/01/2015 by Arnar Pálsson

Sorry, this entry is only available in Icelandic.

Posted in General biology, Publications

Academic advisor for Dr. Sara Sigurbjornsdottir

Posted on: 04/01/2015 by Arnar Pálsson

I had the great fortune of serving as the academic advisor of Sara Sigurbjornsdottir, who defended her Ph.D thesis Monday the 5th of January. The thesis is titled: Complex cell shape: Molecular mechanisms of tracheal terminal cell development in Drosophila melanogaster.

Sara worked on development of terminal cells in the tracheal system of the fruitfly, focusing on characterizing gene function and pathways that affect both formation and maturation of the cells.

She worked at the European Molecular Biology Laboratory (EMBL) in Heidelberg, Germany in the laboratory of dr. Maria Leptin, EMBO Director. The doctoral committee also includes our gentle selves, and two great molecular biologists dr. Marko Kaksonen, and dr. Stefano De Renzis, both group leaders at the European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg, Germany.

Official opponents were dr. Stefan Luschnig, Senior Research Associate, Institute of Molecular Life Sciences, University of Zurich, Switzerland and dr.
Thorarinn Gudjonsson, Professor at the Faculty of Medicine, School of Health Sciences, University of Iceland.

See abstract of her talk and further details.

Her published paper on Molecular mechanisms of de novo lumen formation.

Posted in General biology