- Blóðskömm á Íslandi 1270-1870. Reykjavík: Háskólaútgáfan 1993.
- Árni Magnússon. Ævisaga. Reykjavík: Mál og menning 1998.
- Skjalalestur. Sýnishorn ritheimilda. Reykjavík: Þjóðskjalasafn Íslands 2001 og 2003 (meðhöfundur Kristjana Kristinsdóttir).
- Arnas Magnæus Philologus (1663-1730). Viking Collection 20. Odense: University Press of Southern Denmark 2012.
Útgáfur - Text editions
- Dulsmál 1600-1900: fjórtán dómar og skrá. Már Jónsson bjó til prentunar og skrifar inngang. Heimildasafn Sagnfræðistofnunar 2. Reykjavík: Háskólaútgáfan 2000.
- Til merkis mitt nafn. Dómabækur Markúsar Bergssonar sýslumanns Ísafjarðarsýslu 1711-1729. Már Jónsson tók saman. Sýnisbók íslenskrar alþýðumenningar 6. Reykjavík: Háskólaútgáfan 2002.
- Jónsbók. Lögbók Íslendinga. Már Jónsson tók saman. Sýnisbók íslenskrar alþýðumenningar 8. Reykjavík: Háskólaútgáfan 2004.
- Guðs dýrð og sálnanna velferð. Prestastefnudómar Brynjólfs biskups Sveinssonar 1639-1674. Már Jónsson tók saman. Sýnisbók íslenskrar alþýðumenningar 10. Reykjavík: Háskólaútgáfan 2005.
- Járnsíða og kristinréttur Árna Þorlákssonar. Haraldur Bernharðsson, Magnús Lyngdal Magnússon og Már Jónsson tóku saman. Smárit Sögufélags. Reykjavík: Sögufélag 2005.
- Í nafni heilagrar guðdómsins þrenningar. Prestastefnudómar Jóns biskups Vídalíns árin 1698-1720. Már Jónsson og Skúli Ólafsson tóku saman. Sýnisbók íslenskrar alþýðumenningar 12. Reykjavík: Háskólaútgáfan 2006.
- Eftir skyldu míns embættis. Prestastefnudómar Þórðar biskups Þorlákssonar árin 1675-1697. Már Jónsson og Gunnar Örn Hannesson tóku saman. Sýnisbók íslenskrar alþýðumenningar 12. Reykjavík: Háskólaútgáfan 2008.
- Galdrar og siðferði í Strandasýslu á síðari hluta 17. aldar. Már Jónsson tók saman. Hólmavík: Strandagaldur 2008.
- Hvítur jökull, snauðir menn. Eftirlátnar eigur alþýðu í efstu byggðum Borgarfjarðar á öðrum fjórðungi 19. aldar. Már Jónsson bjó til prentunar. Reykholt: Snorrastofa 2014.
- Sterbúsins fémunir framtöldust þessir. Eftirlátnar eigur 96 Íslendinga sem létust á tímabilinu 1722–1820. Már Jónsson bjó til prentunar. Reykjavík: Háskólaútgáfan 2015.
- Jón Guðmundsson, Spánverjavígin. Euskal baleazaleen hilketa 1615. Ritstjórar Xabier Irujo og Hólmfríður Matthíasdóttir. Reykjavík: Forlagið 2015. Athugasemd: Ég skrifaði inngang, bls. 25–49, sem var þýddur á ensku, spænsku og basknesku. Einnig bjó ég íslenskan texta Jóns til prentunar, bls. 51–102. Textinn var þýddur á ofangreind tungumál eftir útgáfu Jónasar Kristjánssonar frá 1950.
- Bréf Jóns Thoroddsens. Már Jónsson bjó til prentunar. Reykjavík: Sögufélag 2016.
- Fyrirfundnir fémunir í Vestmannaeyjum á fjórða áratug 19. aldar. Már Jónsson bjó til prentunar. Vestmannaeyjar: Þekkingarsetur og Safnahús 2017.
- Jón Thoroddsen, Piltur og stúlka. Már Jónsson bjó til prentunar. Selfoss: Sæmundur 2018.
- Þessi sárfátæka sveit. Lausafjáreign í Grindavík og Krísuvík árin 1773–1824. Már Jónsson bjó til prentunar. Grindavík: Grindavíkurbær 2018.
- Undur yfir dundu. Frásagnir af Kötlugosum 1625–1860. Már Jónsson bjó til prentunar. Vík í Mýrdal: Katla jarðvangur 2018.
- Draumadagbók Sæmundar Hólm. Már Jónsson bjó til prentunar. Selfossi: Sæmundur 2019.
- Reisubók séra Ólafs Egilssonar og aðrir textar um Tyrkjaránið 1627. Már Jónsson og Kári Bjarnason bjuggu til prentunar. Selfossi: Sæmundur 2020.
- Galdur og guðlast á 17. öld. Dómar og bréf. Tvö bindi. Útgefandi Már Jónsson. Reykavík: Sögufélag 2021.
Þýðingar - Translations
- Ezio Ornato, Lofræða um handritamergð. Hugleiðingar um bóksögu miðalda. Þýðendur Björg Birgisdóttir og Már Jónsson. Ritsafn Sagnfræðistofnunar 36. Reykjavík: Háskólaútgáfan 2003.
- Jean-Jacques Rousseau, Samfélagssáttmálinn. Íslensk þýðing eftir Björn Þorsteinsson og Má Jónsson sem einnig ritar inngang. Lærdómsrit Bókmenntafélagsins. Reykjavík: Hið íslenska Bókmenntafélag 2004.
- Patricia Boulhosa, Gamli sáttmáli. Tilurð og tilgangur. Þýðandi Már Jónsson. Smárit Sögufélags. Reykjavík: Sögufélag 2006.
- Johann Anderson, Frásagnir af Íslandi ásamt óhróðri Göries Peerse og Dithmars Blefkens um land og þjóð. Gunnar Þór Bjarnason og Már Jónsson önnuðust útgáfuna. Þýdd rit síðari alda um Ísland og Íslendinga 5. Reykjavík: Sögufélag 2013.